אחרי שמשטרת ישראל הודיעה על פענוח ההצתה במתחם חודורוב, הוגש כתב אישום נגד חמשת החשודים בביצוע העבירה, בגין קשירת קשר לפשע, הצתה של נכס המשמש את הציבור, הסגת גבול והשחתת נכס מקרקעין. נגד שלושה מהם הוגש אישום נוסף, בגין קשירת קשר לעוון, הסגת גבול והשחתת פני מקרקעין.
בבקשה למעצר עד תום ההליכים המשפטיים נגדם נכתב: "מכתב האישום עולה כי, על רקע היות המשיבים אוהדי בית"ר ירושלים, ומעורבותם בארגון האוהדים 'לה פמיליה', קשרו יחדיו קשר פלילי במסגרתו הסיגו גבול לתוך מתחם האימונים של מועדון הפועל תל אביב, לילה עובר למשחק יריבות בין שתי הקבוצות, והציתו את המתחם באמצעות השלכת בקבוקי תבערה לתוך משרדי הפועל".
"לאחר ששילחו את האש במתחם, הותירו המשיבים את המקום כשאש מיתמרת מכלה את המשרדים וגורמת לנזק עצום, באישון ליל, מבלי להזעיק כוחות הצלה ונסעו לעבר פסי רכבת בנס ציונה שם ריססו את הכתובת 'לא נשרפתם רק בשואה'". עוד נכתב כי אחד הנאשמים: "אף הגדיל לעשות ותיעד את השריפה המשתוללת במתחם באמצעות רחפן וכן את דמותו לצד כתובת הגרפיטי לעיל, ודאג להפצת הסרטונים ברשתות החברתיות תוך קישורים לארגון לה פמיליה".