בני סכנין הוקמה בסוף שנות ה-70 ולאורך כל השנים שיחקה בליגות נמוכות. בעונת 2003 היא העפילה לליגת העל בפעם הראשונה בהיסטוריה והפכה לקבוצה הערבית השלישית המשחקת בליגה הבכירה. בנוסף, בעונתה הראשונה בליגה הבכירה זכתה בגביע לאחר שניצחה בגמר את הפועל חיפה ובעקבות זאת ייצגה את ישראל בגביע אופ"א.
תארים:
גביע המדינה (1) - 2004